（二）删去第六条中的“（编号格式见附件5）”、第七条中的“（附件二）”、第八条中的“（附件1）”、第九条中的“附件3”、第十三条中的“附件4”。
（三）将第十九条中的“检验检疫机构”修改为“主管海关”。
（四）删去第三十六条中的“并出具《出境货物通关单》”。
（五）增加一条，作为第三十八条“本办法所规定的文书由海关总署另行制定并且发布。”
（六）对条文顺序作相应调整。
（七）删去附件。
二十一、对《供港澳活猪检验检疫管理办法》（国家出入境检验检疫局令第27号公布）作如下修改：
（一）将第三条、第四条、第七条、第十条至第十四条、第十八条、第二十一条至第二十七条、第二十九条至第四十一条中的“国家出入境检验检疫局（以下简称国家检验检疫局）”“国家检验检疫局”修改为“海关总署”，“国家检验检疫局设在各地的直属出入境检验检疫机构（以下简称直属检验检疫机构）”“直属检验检疫机构”修改为“直属海关”，“检验检疫机构”修改为“海关”。
（二）删去第七条中的“（编号格式见附件1）”、第八条中的“（附件2）”、第九条中的“（附件3）”、第十条中的“附件4”、第十四条中的“附件5”。
（三）删去第三十六条第（一）项中的“并出具《出境货物通关单》”和第（二）项中的“出具《出境货物通关单》”。
（四）增加一条，作为第四十条“本办法所规定的文书由海关总署另行制定并且发布。”
（五）对条文顺序作相应调整。
（六）删去附件。
二十二、对《出入境检验检疫风险预警及快速反应管理规定》（国家质量监督检验检疫总局令第1号公布）作如下修改：
（一）将第三条、第四条、第七条、第八条、第十条、第十三条、第十四条、第十七条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”。
（二）将第九条、第十五条中的“各地出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫机构）”“检验检疫机构”修改为“海关”。
二十三、对《出入境快件检验检疫管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第3号公布）作如下修改：
（一）将第三条中的“《出入境检验检疫机构实施检验检疫的进出境商品目录》”修改为“海关实施检验检疫的进出境商品目录”。
（二）将第四条、第十四条、第三十一条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫机构）”修改为“主管海关”。
（三）删去第五条、第六条、第九条至第十二条。
（四）将第十三条修改为“快件运营人应按有关规定向海关办理报检手续。”
（五）将第十四条至第十八条、第二十一条、第二十二条、第二十四条、第二十六条至第二十八条中的“检验检疫机构”修改为“海关”。
（六）将第十九条中的“国家质检总局规定的”修改为“相关”。
（七）对章节、条文顺序作相应调整。
二十四、对《进口许可制度民用商品入境验证管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第6号公布）作如下修改：
（一）将第三条、第六条至第八条、第十条中的“出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫机构）”“检验检疫机构”修改为“海关”。
（二）将第四条、第五条、第九条、第十一条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的检验检疫机构”“检验检疫机构”修改为“主管海关”。
（三）将第五条中的“《出入境检验检疫机构实施入境验证的进口许可制度民用商品目录》”修改为“海关实施入境验证的进口许可制度民用商品目录”。