二十九、对《进出口商品抽查检验管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第39号公布）作如下修改：
（一）将第四条至第六条、第十条、第三十一条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫机构）”修改为“主管海关”。
（二）将第七条、第八条、第十四条、第十六条、第十八条、第二十一条、第二十二条、第二十五条、第二十六条、第二十八条、第二十九条中的“检验检疫机构”修改为“海关”。
（三）将第九条中的“检验检疫有关人员”修改为“海关有关人员”。
（四）将第十一条修改为“主管海关根据抽查检验计划，经过必要调查，结合本地区相关进出口商品实际情况，确定被抽查检验单位，制订具体实施方案，并报海关总署备案。”
（五）将第十二条修改为“主管海关应当按照对抽查检验工作的统一部署和要求，认真组织实施本地区的抽查检验。”
（六）将第二十三条修改为“主管海关在完成抽查检验任务后，应当在规定的时间内上报抽查结果，并将抽查情况及结果等有关资料进行立卷归档，未经同意，不得擅自将抽查结果及有关材料对外泄露。”
（七）将第二十四条中的“检验检疫机构应当将国家质检总局公布的抽查检验结果、预警通告等及时通报给当地有关部门和企业”修改为“主管海关应当将公布的抽查检验结果、预警通告等及时通报给当地有关部门和企业”。
（八）将第二十七条中的“根据国家质检总局规定对拒绝接受抽查检验的企业予以公开曝光”修改为“根据相关规定对拒绝接受抽查检验的企业予以公开曝光”。
三十、对《进境动物和动物产品风险分析管理规定》（国家质量监督检验检疫总局令第40号公布）作如下修改：
将第三条、第五条、第十九条、第二十六条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”。
三十一、对《进境植物和植物产品风险分析管理规定》（国家质量监督检验检疫总局令第41号公布）作如下修改：
将第三条、第五条、第八条至第十条、第十二条、第十四条、第十九条、第二十条、第二十二条至第二十四条、第二十七条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“检验检疫机构”修改为“海关”。
三十二、对《中华人民共和国实施金伯利进程国际证书制度管理规定》（国家质量监督检验检疫总局令第42号公布，根据国家质量监督检验检疫总局令第184号和第196号修改）作如下修改：
（一）将第三条、第十六条、第二十二条中的“中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫机构）”修改为“主管海关”。
（二）将第五条、第七条至第十五条、第十八条、第十九条中的“检验检疫机构”修改为“海关”。
（三）将第六条修改为“进出口毛坯钻石的受理申报、核查检验，由主管海关办理。”
（四）删去第九条第二款。
（五）将第十三条第一款修改为“海关受理申报后，应当在指定地点及申报人在场的情况下，对毛坯钻石原产地的真实性等进行核实，对毛坯钻石的克拉重量（数量）进行检验，并对申报金额进行核定。在确认申报人所申报的内容正确无误后，对符合金伯利进程国际证书制度要求的毛坯钻石及其包装容器进行封识，加施原产地注册标记，并签发《金伯利进程国际证书》”。
（六）删去第七条中的“（附件3）”、第十二条中的“（附件4）”、第二十一条中的“附件5”。
（七）增加一条，作为第二十二条“本办法所规定的文书由海关总署另行制定并且发布。”
（八）对条文顺序作相应调整。