（2）同一笔出口业务涉及多个供货方的检查。
一是根据申报的退税凭证及发票号（大多数外贸企业填运编号）等相关资料，要求被查企业提供相对应的内外销合同，检查人员根据已签订的内销合同，判断用于申报退税凭证上的供货商是否为被查企业的合作伙伴。
二是检查同一关联号项下所出口的货物，是否属同一笔出口业务，出口的时间、出口货物名称、出口总额、境外客户是否相匹配。
三是分析同一关联号项下所涉及的供货方销售的货物，相互之间有何关联，与境外客户签约所指的货物是否一致。对不一致的，都要延伸到供货方，重点调查供货方的生产能力。
（3）按商品扩展码申报退税的出口货物的检查。检查人员可通过《出口退税信息管理系统》中的“进货明细数据”,对照商品扩展码进行查找，确定相对应的申报年月及申报序号，进而查找原始退税凭证。
一是根据“申报年月+序号”查找企业已申 报的增值税专用发票，对照海关编码，分析判断专用发票上注明的货物名称应适用的海关编码。
二是当检查人员认定的海关商品编码与该企业申报出口的海关编码不一致时，可到海关、货代公司进行调查，或向专门行业协会咨询，通过多方调查确定相对准确的商品编码。
三是到供货企业进行实地调查。一方面向当地主管税务部门了解如何管理供货方销售该货物，增值税税率的认定情况等；另一方面了解该出口货物的生产过程、原材料耗用及采 购情况等。
（4）出口换汇成本过高出口货物的检查。
一是审核被查企业申请人工处理时所陈述的事实是否合理；
二是检查该笔出口货物的真实性。
（5）委托加工出口货物的检查。
一是检查外贸企业申报的委托加工出口货物是否真实，检查企业与开具加工费生产企业是否签订了加工合同，加工的品名、数量、加工期与实际是否相吻合，核实所购的原辅材料与所加工的货物之间关联点。
二是实地到加工企业进行调查：加工企业是否具有生产能力，原辅材料入库的时间、数量及品种规格的记录，车间领用材料的记录，将加工货物运至机场、码头、港口等地的运输记录等。
三是通过出成率（成品数量与主要原材料之比）来检测出口货物所耗用的原材料是否合理，出成率高于本地区同行业水平的，说明申报出口货物的数量不足或者虚增了原料数量，可能存在骗取出口退税行为。
四是检查加工费发票上注明的数量与实际出口数量是否一致；检查申报退税的凭证中，有没有加工费的发票，特别是当原材料所适用的退税率高于出口货物的退税率时，更应检查加工企业开具的发票是否符合规定，外贸企业申报的退税率是否准确。
五是检查开具原辅材料上增值税专用发票上注明的纳税人与实际销货单位是否一致。
（6）进料加工复出口货物的检查。
一是查清被查企业从事的进料加工复出口业务所采用的材料核算方式。检查人员可根据主管退税税务部门已出具的《外贸企业进料加工贸易免税证明》所对应的《加工贸易登记手册》上的手册号，与进料加工贸易海关信息比对，核对一致的为作价加工形式，不一致的为不作价调拨。
二是进料以作价形式加工的， 检查作价的进口料件是否低于进口时的到岸价格，造成少计算抵扣税款；申报的进口料件征税率是否准确，初级工业品是否以农产品名义按 13％征税率申报；是否存在申报办理免税证明时复出口货物的商品代码与报关出口不一致，且按低退税率申报，造成少计算抵扣税款的情况。
三是进料以不作价形式调拨的，检查该笔进料加工业务是否己开具了销售发票（包括增值税专用发票和普通发票）；加工企业是否与被查企业签订加工合同，加工的数量、品种是否如合同所签；是否取得加工费发票；其他辅料的进货凭证是否合理合法；将调拨的进口料件还原，重新计算该批复出口货物的出口换汇成本。
5.视同内销征税的出口货物有无申报纳税的检查
一是检查视同内销征税出口货物的范围。