二、营业税
重点检查是否存在以下问题：
（一）营业收入是否完整及时入账
1.现金收入不按规定入账。
2.不给客户开具发票，相应的收入不按规定入账。
3.收入长期挂帐不转收入。
4.向客户收取的价外收费未依法纳税。
5.以劳务、资产抵债未并入收入记税。
6.不按《营业税条例》规定的时间确认收入，递延纳税义务。
（二）关联企业间提供应税劳务、转让无形资产、销售不动产价格明显偏低又无正当理由，申报纳税时不做调整。
（三）按税法规定负有营业税扣缴义务而未依法履行扣缴税款。
（四）兼营不同税率的业务时，高税率业务适用低税率。
三、企业所得税
自查各项应税收入是否全部按税法规定缴税，各项成本费用是否按照所得税税前扣除办法的规定税前列支。具体自查项目应至少涵盖以下问题：
（一）收入方面
1．企业资产评估增值是否并入应纳税所得额。（中国财税浪子王骏批注，总局的提纲中为何老出现这一条，纯粹是低级错误）
2．企业拥有境外投资，境外被投资企业在进行利润分配后，投资收益是否并入当期应纳税所得税计税。
3．企业取得的各种收入是否存在未按所得税权责发生制原则确认计税的问题。
4．是否存在利用往来账户延迟实现应税收入或调整企业利润。
5．取得非货币性资产收入或权益是否计入应纳税所得额。
6．是否存在视同销售行为未作纳税调整。
7．是否存在各种减免流转税及各项补贴、收到政府奖励，未按规定计入应纳税所得额。
8．是否存在接受捐赠的货币及非货币资产，未计入应纳税所得额。
9．是否存在企业分回的投资收益，未按地区差补缴企业所得税。（中国财税浪子王骏批注，旧税法时期才适用）
（二）成本费用方面
1．是否存在利用虚开发票或虚列人工费等虚增成本。
2．是否存在使用不符合税法规定的发票及凭证，列支成本费用。
3．是否存在将资本性支出一次计入成本费用：在成本费用中一次性列支达到固定资产标准的物品未作纳税调整；达到无形资产标准的管理系统软件，在营业费用中一次性列支，未进行纳税调整。
4．内资企业的工资费用是否按计税工资的标准计算扣除；是否存在工效挂钩的工资基数不报税务机关备案确认，提取数大于实发数。
5．是否存在计提的职工福利费、工会经费和职工教育经费超过计税标准，未进行纳税调整。
6．是否存在计提的养老保险、医疗保险、失业保险和职工住房公积金超过计税标准，未进行纳税调整。
7．是否存在擅自改变成本计价方法，调节利润。
8．是否存在超标准计提固定资产折旧和无形资产摊销：计提折旧时固定资产残值率低于税法规定的残值率或电子类设备折旧年限与税收规定有差异的，未进行纳税调整；计提固定资产折旧和无形资产摊销年限与税收规定有差异的部分，是否进行了纳税调整。
9．是否存在超标准列支业务宣传费、业务招待费和广告费。
10．是否存在擅自扩大技术开发费用的列支范围，享受税收优惠。
11．专项基金是否按照规定提取和使用。
12．是否存在企业之间支付的管理费、企业内营业机构之间支付的租金和特许权使用费进行税前扣除。
13．是否存在扩大计提范围，多计提不符合规定的准备金，未进行纳税调整。
14．是否存在从非金融机构借款利息支出超过按照金融机构同期贷款利率计算的数额，未进行纳税调整。
15．企业从关联方借款金额超过注册资金50%的，超过部分的利息支出是否在税前扣除。
16．是否存在已作损失处理的资产，部分或全部收回的，未作纳税调整；是否存在自然灾害或意外事故损失有补偿的部分，未作纳税调整。
17．是否存在开办费摊销期限与税法不一致的，未进行纳税调整。
18．是否存在不符合条件或超过标准的公益救济性捐赠，未进行纳税调整。
19．是否存在支付给总机构的管理费无批复文件，或不按批准的比例和数额扣除，或提取后不上交的，未进行纳税调整。
20．是否以融资租赁方式租入固定资产，视同经营性租赁，多摊费用，未作纳税调整。
（三）关联交易方面
是否存在与其关联企业之间的业务往来，不按照独立企业之间的业务往来收取或者支付价款、费用而减少应纳税所得额的，未作纳税调整。