第三章 组织实施
第十四条 主管税务机关要统一调配力量组织实施企业所得税检查，将参加检查 的人员划分为若干检查小组，把检查任务具体落实到检查小组，每个检查小组至少由 2个以上检查人员组成。
第十五条 检查小组在实施检查前要详细了解被检查纳税人的基本情况，包括生产经营情况、财务管理情况、同业经营情况、企业所得税纳税情况、以前年度的企业 所得税和其他税种检查发现的问题，确定企业所得税检查的范围、重点、策略、时间、 进度、人员分工等。
第十六条 企业所得税检查应区别纳税人的情况，分别实施案头审核、调帐检查 和实地检查。
第十七条 企业所得税的案头审核是对纳税人填报的企业所得税申报表及附表资料的审查核对和税额评定。企业所得税的案头审核以数据验算和指标分折复核为主。 对企业所得税申报表的有关收入、扣除项目或政策运用有疑问的，主管税务机关可向 纳税人发出问询函，实施函查，要求纳税人作出说明或补充资料。
第十八条 企业所得税的调帐检查是将纳税人的帐簿、凭证和有关资料，调到税务机关进行检查。对内部管理制度健全、财务管理规范、帐证完整的纳税人，应尽可能实行调帐检查。
第十九条 企业所得税的实地检查是税务检查人员*纳税人的经营管理现场进 行检查。对内部管理制度不健全的纳税人，或内部管理制度健全，但因种种原因不能 调帐检查的纳税人，可进行实地检查。
第二十条 实施企业所得税检查要详细查阅纳税人的帐簿、凭证；查阅与生产经营有关的重要文件，如供销合同、董事会或企业经理会议记录；与有关人员进行座谈； 如有必要，可对相关实物资产进行盘点、核对。
第二十一条 企业所得税检查必须保留完整的检查工作底稿。企业所得税检查工作底稿是企业所得税检查人员在实施检查过程中形成的全部工作记录和取得的证据、资料，包括具体检查计划、检查过程记录、检查发现问题和证据、初步处理意见和政策依据。
第二十二条 企业所得税检查主要是对纳税人应纳税收入总额、准予扣除项目、适用税率及优惠政策的合理性、合法性和真实性进行的审核和检查。根据纳税人的具体情况可以实施全面检查，也可以抽查。
第二十三条 收入总额的检查范围包括纳税人取得的一切收入。收入总额检查的目标是，确定应税收入的完整性，检查纳税人是否有隐瞒未申报的应纳税收入；确定应税收入的确认的合法性，检查纳税人应税收入的确认是否符合企业所得税法规和规章规定的实现原则和方法，有否推迟或提前确认收入的情况；确定应税收入与非应税收入划分的准确性，检查纳税人有否将应税收入作为非应税收入申报的情况。
第二十四条 准予扣除项目的检查范围包括对纳税人申报的与应纳税收入有关的全部扣除项目。扣除项目检查的目标是，确定申报的扣除项目的真实性，检查纳税人有否虚报扣除；确定申报的扣除项目与应纳税收入的配比性，检查纳税人有否将非应 税收入的费用申报为与应税收入有关的扣除，有否将资本性支出作为期间费用扣除等；确定申报的扣除项目的必要性、合理性，检查纳税人申报的扣除项目是否是为取得应 纳税收入的正常支出，是否符合会计惯例和经营常规，是否符合企业所得税法规、规章规定的标准。
第二十五条 企业所得税税率和优惠政策的检查范围包括纳税人适用的税率和优惠政策。检查目标是，确定纳税人申报的适用税率和优惠政策的合法性，检查纳税人有否错用税率和优惠政策的情况；确定纳税人适用的优惠政策是否符合规定的批准程序等。
第四章 审理终结
第二十六条 企业所得税检查实施完成后，对未发现纳税人有违反企业所得税法规和规章的行为或偷逃税等问题的，检查小组应及时填写检查终结结论，经业务管理 部门审核，税务机关主管负责人签字，加盖税务机关公章后，书面通知纳税人。对企业所得税检查中发现的一般性违法问题，凡不需要立案查处的，检查完毕后，由检查小组填写税务检查处理决定书，经业务管理部门审核，按规定程序报批后，通知纳税 人执行。对检查中发现需要立案处理的问题，检查小组长应按规定程序填制税务检查 报告，送交审理部门进行审理，审理部门按规定审理完毕后，填制税务处理决定书， 经审批后，由有关部门执行。对涉嫌构成犯罪的，经批准，填制税务违法案件移送书，移交有关部门处理。