联查过程中需要收集相关资料的，由联查办案小组确定收集资料清单，由税务总局指定税务机关统一送达纳税人。
被联查纳税人各成员单位所在地主管税务机关特别是总部所在地主管税务机关，应当积极配合收集相关资料并提供给联查办案小组。
第七条 主管税务机关需要收集属于其他省（市）税务机关管辖的被调查纳税人关联方或可比对象相关资料的，应当填写《特别纳税调整工作联系单（适用于协查）》（附件2），层报省级税务机关，由省级税务机关转发办理。
主管税务机关需要获取中央各部委有关信息资料的，应当层报税务总局，由税务总局审核后按规定程序办理；需要通过境外税务主管当局获取境外有关信息资料的，应当层报税务总局，由税务总局审核后根据我国对外签订的协定、协议或者安排的有关规定与境外税务主管当局开展信息交换。
第八条 主管税务机关办案小组应当集体研究讨论形成案件初步调整方案或不予调整的意见和理由，填制《特别纳税调整结案审核表》（附件3），并附结案报告以及有关资料，通过案件管理系统层报省级税务机关，由省级会审小组集体审核。
第九条 属于全国联查案件的重大案件，由主管税务机关填制《特别纳税调整结案审核表》，并附结案报告以及有关资料通过案件管理系统层报税务总局，按照有关规定由全国会审小组集体审核，无需经过省级会审小组集体审核。
除全国联查案件以外的重大案件，经省级会审小组审核同意后，通过案件管理系统呈报税务总局，按照有关规定由全国会审小组集体审核。
全国会审小组集体审核案件时，可以听取办案小组成员和省级会审小组成员对案件调查具体情况的汇报，共同讨论、评议案件。
第十条 重大案件包括：
（一）全国联查案件。
（二）转让定价调查初步调整方案单案补税金额1000万元以上的案件。
（三）涉及成本分摊管理的案件。
（四）涉及受控外国企业管理的案件。
（五）涉及资本弱化管理的案件。
（六）涉及一般反避税管理的案件。
（七）其他税务总局确定的案件。