国土资源部门
1.地质成果资料费
环境保护部门
2.城市放射性废物送贮费
3.登记费。包括：进口废物环境保护审查登记费，化学品进口登记费
交通运输部门
4.船舶登记费
5.船舶及船用产品设施检验费（中国籍非入级船舶法定检验费）
卫生计生部门
6.卫生检测费
7.委托性卫生防疫服务费
水利部门
8.河道工程修建维护管理费
9.河道采砂管理费（含长江河道砂石资源费）
农业部门
10.植物新品种保护权收费
11.农药、兽药注册登记费。包括：农药登记费，进口兽药注册登记审批、发证收费
12.检验检测费。包括：新饲料、进口饲料添加剂质量复核检验费，饲料及饲料添加剂委托检验费，新兽药、进口兽药质量标准复核检验费，进出口兽药检验费，兽药委托检验费，农作物委托检验费，农机产品测试检验费，农业转基因生物检测费，渔业船舶和船用产品检验费
质检部门
13.出入境检验检疫费
14.产品质量监督检验费（含工业产品生产许可证发证检验费，不含按经营服务性收费管理的自愿委托检验费）
15.计量收费（即行政审批和强制检定收费。非强制检定收费不得列入行政事业性收费，不得强制企业接受服务并收费）
食品药品监管部门
16.认证费。包括：药品生产质量管理规范认证费，药品经营质量管理规范认证费
17.检验费。包括：药品检验费，医疗器械产品检验费
18.麻醉、精神药品进出口许可证费
19.药品保护费。包括：药品行政保护费，中药品种保护费
新闻出版广电部门
20.计算机软件著作权登记费
民航部门
21.民用航空器国籍、权利登记费
林业部门
22.植物新品种保护权收费
测绘地信部门
23.测绘成果成图资料收费
二、取消或停征的涉及个人等事项的行政事业性收费（共6项）
（一）取消的涉及个人等事项的行政事业性收费（共4项）
卫生计生部门
1.预防性体检费
体育部门
2.兴奋剂检测费
中直管理局
3.机要交通文件（物件）传递费
相关部门和单位
4.培训费。包括：中国纪检监察学院培训费，国家法官学院培训费，中央团校培训费，中央党校培训费
（二）停征的涉及个人等事项的行政事业性收费（共2项）
民政部门
1.登记费。包括：婚姻登记费，收养登记费
相关部门和单位
2.依申请提供政府公开信息收费。包括：检索费，复制费（含案卷材料复制费），邮寄费