（二）将第三条、第四条、第二十四条、第三十五条至第三十九条、第四十三条中的“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫部门（以下简称检验检疫部门）”“检验检疫部门”修改为“主管海关”。
（三）将第十一条至第十七条、第十九条、第二十条、第二十三条、第二十七条至第三十条、第三十二条、第三十三条、第三十五条第（三）项、第四十条、第四十二条、第四十四条至第五十七条中的“检验检疫部门”修改为“海关”。
（四）删去第二十二条中的“国家质检总局”。
（五）将第二十五条、第四十二条中的“直属检验检疫局”修改为“直属海关”。
（六）删去第三十条第一款中的“《出境货物通关单》或者”。
（七）将第三十二条第二款修改为“出境粮食经产地检验检疫合格后，出境口岸海关按照相关规定查验，重点检查货证是否相符、是否感染有害生物等。查验不合格的，不予放行”。
（八）删去第五十条中的“货物通关单”。
六十六、对《出入境检疫处理单位和人员管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第181号公布）作如下修改：
（一）将第三条、第七条、第十五条至第十九条、第二十二条、第二十四条、第二十五条、第二十七条、第三十三条至第三十八条、第四十条、第四十一条中的“直属出入境检验检疫局（以下简称直属检验检疫局）”“直属检验检疫局”修改为“直属海关”。
（二）将第四条、第十七条、第二十二条、第四十九条、第五十条中的“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫部门（以下简称检验检疫部门）”修改为“主管海关”。
（三）将第六条、第二十七条至第三十条、第三十九条至第四十二条中的“检验检疫部门”修改为“海关”。
（四）将第三十六条、第四十三条中的“检验检疫部门人员”“检验检疫人员”修改为“海关工作人员”。
六十七、对《国境口岸卫生许可管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第182号公布）作如下修改：
（一）将第三条、第四十条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫机构（以下简称检验检疫部门）”修改为“主管海关”。
（二）将第五条至第八条、第十九条至第二十三条、第二十五条至第三十条、第三十六条至第三十九条、第四十四条至第四十九条中的“检验检疫部门”修改为“海关”。
（三）删去第二十条、第二十五条中的“质量监督检验检疫”。
六十八、对《出入境邮轮检疫管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第185号公布）作如下修改：
（一）将第三条、第五条、第九条、第十五条第（二）项和第（三）项、第二十四条第（一）项、第三十三条、第四十四条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫部门（以下简称检验检疫部门）”“检验检疫部门”修改为“主管海关”。
（二）将第四条、第八条、第十条至第十八条、第二十条至第二十七条、第二十九条至第三十二条、第三十五条、第三十七条至第四十二条中的“国家质检总局及检验检疫部门”“检验检疫部门”修改为“海关”。
（三）将第三十七条第（一）项中的“直属检验检疫局”修改为“直属海关”。
六十九、对《进出口工业品风险管理办法》（国家质量监督检验检疫总局令第188号公布）作如下修改：
将第四条至第六条、第九条至第十二条、第十四条至第十六条、第十八条至第二十七条、第三十条、第三十一条中的“国家质量监督检验检疫总局（以下简称国家质检总局）”“国家质检总局”修改为“海关总署”，“国家质检总局设在各地的出入境检验检疫部门（以下简称检验检疫部门）”修改为“主管海关”，“检验检疫部门”修改为“海关”。