而且新企业所得税法出台后，各地还相继发布了针对研发费用加计扣除的具体审核管理办法，基本沿袭了以前财税[2006]88号文和财企[2007]194号文（以下分别简称为“88号文”和“194号文”）的规定，如安徽省出台了《企业研究开发费用所得税前加计扣除政策具体操作办法》（科策[2008]77号文），116号文的颁布显然对这些林林总总的文件规定进行了统一，从加计扣除的适用对象、研发活动的具体定义、研发费用的具体范围、不同的研发方式（如合作开发、委托研发、集团集中研发）的执行办法、加计扣除的财务核算、加计扣除的税收管理等方面，对研发费用的加计扣除问题做出了系统而详细的规定。
根据2008年1月1日起生效施行的《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例，企业“开发新技术、新产品、新工艺发生的研究开发费用，可以在计算应纳税所得额时加计扣除”，其中“未形成无形资产计入当期损益的，在按照规定据实扣除的基础上，按照研究开发费用的50%加计扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的150%摊销”。