第十一条 为鼓励和支持支线航空运输发展，飞机最大起飞全重在50吨以下的机型在省（自治区、直辖市）内飞行或跨省（自治区、直辖市）飞行且里程在600公里以内（含600公里）的，按照相应航线类型的征收标准减半计征民航发展基金。
第十二条 专机、航空公司调机、训练飞行、中止的商业运输（航班返航）以及除公务飞行以外的其他通用航空业务免缴民航发展基金。
第十三条 国内联程、经停航班以两点间航段作为航线归类和结算依据。备降航班按实际飞行的航线、航班计算征收民航发展基金。
第十四条 民航发展基金由财政部委托民航局统一组织征收，民航局清算中心（以下简称“清算中心”）具体负责民航发展基金的征收工作。
第十五条 航空旅客应缴纳的民航发展基金，由航空公司或者销售代理机构在旅客购买机票时一并代征。
航空公司或者销售代理机构开具的民航客票行程单中应当单独列明代征的民航发展基金，并套印财政部财政票据监制章。
旅客在办理退票时，航空公司或者销售代理机构应全额退还代征的民航发展基金。
航空公司或者销售代理机构代征的民航发展基金，由清算中心负责征收并全额上缴中央国库。
第十六条 航空公司应缴纳的民航发展基金由清算中心直接征收，并全额上缴中央国库。
第十七条 民航各地区空管局、各机场（集团）应当于每月5日前，将上月民航发展基金相关统计信息报送清算中心。
清算中心应认真核对相关信息，确定民航发展基金的征收数额，并于每月15日前向航空公司下达缴款通知书。
第十八条 清算中心应以航空公司本部或其独立核算的子公司作为缴款通知书的开具对象。国内航线实行代码共享的航班，以执行航班的航空公司作为缴款通知书的开具对象。
民航发展基金在实行代码共享的航空公司之间的分摊和结算办法由航空公司自行决定。
第十九条 航空公司收到缴款通知书后，应当于每月20日前将民航发展基金缴入财政部为清算中心开设的中央财政汇缴专户。
清算中心收到民航发展基金后，应当按规定向航空公司开具《非税收入一般缴款书》。
第二十条 航空公司未按照本办法规定及时缴纳民航发展基金，民航局应当按照政府性基金管理的有关规定进行追缴。
第二十一条 民航发展基金缴库时，填列《政府收支分类科目》第103类“非税收入”，01款“政府性基金收入”，10项“民航发展基金收入”（新增）。
第三章 使用管理
第二十二条 民航发展基金使用应当遵循以收定支、统筹安排、专款专用、注重效益的原则。
第二十三条 民航发展基金使用范围如下：
（一）民航基础设施建设，包括机场飞行区、航站区、机场围界、民航安全、空中交通管制系统、科教、信息等基础设施建设，以及归还上述建设项目贷款，安排上述建设项目的前期费用和贷款贴息；
（二）对货运航空、支线航空、国际航线、中小型民用运输机场（含军民合用机场）进行补贴；
（三）民航节能减排，包括支持民航部门及机场、航空企业节能减排新技术研发和推广应用，节能设施或设备更新改造，行业节能减排管理体系建设等；
（四）通用航空发展，包括支持通用航空企业开展应急救援、农林飞行等作业项目，通航飞行员教育培训，通航基础设施建设投入和设备更新、改造等；
（五）民航科教、信息等重大科技项目研发和新技术应用；
（六）加强持续安全能力和适航审定能力建设；
（七）征管经费、代征手续费以及国务院批准的其他支出。
第二十四条 财政部在民航发展基金预算中，按不超过基金收入的1%列支征管经费和代征手续费。
第二十五条 民航发展基金年终结余结转下年度安排使用。
第二十六条 中央本级安排使用的民航发展基金，由民航局根据民航发展基金的使用范围、年度征收情况、投资需求和项目前期准备情况，按照政府性基金预算管理的规定，编制民航发展基金支出预算，报财政部审核。财政部将经批准的民航发展基金支出预算纳入民航局部门预算予以批复。