（三）部门项目配套比例
国土资源部、水利部、农业部、林业局等中央部门组织实施的农业综合开发项目，中央财政资金与地方财政资金、自筹资金配套比例，执行所在省（自治区、直辖市、计划单列市）的配套比例。
三、中央财政无偿资金投入比例
（一）土地治理项目100%无偿投入。其中用于农业机械、配套农机具以及苗圃建设等经营性措施的补贴限额，原则上不得超过土地治理项目财政资金的5%；确需超过5%的，须报经国家农业综合开发办公室同意。
（二）产业化经营项目100%无偿投入。取消中央财政有偿资金，对产业化经营项目分别实行贷款贴息和财政补贴扶持方式。
本规定从2009年1月1日起执行。2008年8月21日财政部发布的《农业综合开发资金若干投入比例的规定》（财发[2008]52号）同时废止。