第十二条 中央部门连续年度安排预算的延续项目，有专项结余资金的，在申报下一年度预算时，应结合项目进展情况主动统筹部分结余资金，再向财政部申请增加预算。对延续项目专项结余较多的部门，财政部在下一年度可适当减少有关项目支出预算。
第十三条 中央部门在年度预算执行过程中，动用净结余资金安排项目支出，或调整项目支出专项结余资金使用用途的，均应报财政部审批。
第十四条 部门基本建设项目结余资金，除按照《财政部关于印发基本建设财务管理规定的通知》（财建[2002]394号）有关规定执行外，还应执行本办法，其中：净结余资金的70%上交中央金库，30%部分按照本办法有关项目支出净结余资金规定条款执行，按照规定的范围使用，使用时报财政部审批。
第四章 结余资金消化的激励措施
第十五条 财政部建立部门消化累计结余资金的激励机制，即对部门累计结余资金比上午减少的部门，财政部允许其在不违反部门预算管理规定和财务制度的前提下，动用一定金额的净结余资金解决应由中央财政负担的本部门历史遗留问题的支出，具体动用时报财政部审批。
第十六条 对累计结余资金比上年增加较多的中央部门，财政部在下达“一下”控制数时，可以视部门结余资金增长情况，适当减小部门项目支出预算增幅或压缩部门财政拨款预算总额。
第五章 结余资金安排使用的程序
第十七条 预算编制阶段，部门结余资金使用按以下程序办理：
（一）按照财政部关于编制部门预算的要求，中央部门在下一年度预算编制阶段，将本部门结余资金（包括基本支出结余和项目支出结余）结转下年安排使用计划，以及拟统筹动用本部门净结余资金安排下一年度有关项目支出预算情况，随部门“一上”预算报送财政部；
（二）财政部根据中央财政预算平衡情况，结合部门“一上”预算、部门累计结余资金情况、部门提出的结余资金下一年度安排使用计划等情况，对部门结余资金安排使用计划进行审核，提出部门下一年度预算结余资金安排使用建议，并随“一下”预算控制数发中央部门；
（三）中央部门根据财政部下达的“一下”预算控制数和结余资金安排使用建议数，调整编制基本支出和项目支出“二上”预算。
第十八条 预算执行中，中央部门需追加预算时，应结合本部门结余资金情况，优先动用其结余资金。结余资金不足以安排时，再向中央财政申请追加预算。
第六章 结余资金的报送及确认
第十九条 预算年度结束后，中央部门应对本部门和所属预算单位的结余资金情况逐级汇总，并对形成结余的原因进行分析说明，于下午2月底之前，将本部门《20××年度财政拨款结余资金情况表》（格式及填制说明见附1、2）和有关说明文件报送财政部。
第二十条 国库集中支付形成的结余资金，中央部门还须按照《财政部关于印发<财政国库管理制度改革试点年终结余资金管理暂行规定>的通知》（财库[2003]125号）有关规定，在1月20日之前，向财政部报送《财政国库管理制度实施单位年终预算结余资金申报核定表》
第二十一条 财政部负责对部门结余资金数额和有关项目完成情况进行审核确认，并于3月底前将审核意见通知中央部门。
第七章 结余资金使用的监督检查
第二十二条 财政部对部门结余资金管理情况进行定期和不定期的检查。
第二十三条 中央部门在结余资金管理中违反本办法的，财政部应当责成其进行纠正，并可以通过调减部门预算等方式将结余资金收回中央总预算。
第八章 附 则
第二十四条 中央部门可在本办法规定之内，结合部门实际情况，制定本部门结余资金的具体管理办法。中国人民解放军、武警部队可以参照本办法的原则，另行制定管理规定。
第二十五条 对纳入预算管理的各项政府性基金项目结余资金，按照各项基金管理的有关规定执行。
第二十六条 所有涉及财政拨款结余资金的预算管理均按本办法执行，本办法由财政部负责解释。