五、凡当月应进行纳税评估的商贸企业，其每月纳税评估必须在当月完成，不得延迟。
六、《商贸企业增值税纳税评估办法》所规定的纳税评估内容必须全面分析，不得遗漏。其中任何一项内容属于异常，即须移送稽查部门进行稽查。
七、纳税申报异常的商贸企业被移送检查后，稽查部门应首先检查确认其是否有虚开专用发票、开具变造专用发票行为，并将确认结果通知纳税评估岗位。如果需要检查被移送的商贸企业是否有其他税收违规行为，对其他税收违规行为的检查，则应在检查确认其是否有虚开专用发票、开具变造专用发票行为，并将确认结果通知纳税评估岗位之后进行。
八、移送检查的商贸企业，需要停供专用发票和收缴其尚未使用的专用发票的，由稽查部门确定并通知发票发售部门执行。移送检查的商贸企业，在检查期间发生销售行为需领购专用发票的，可向稽查部门提出领购申请，由稽查部门审核是否确有货物交易行为及应税销售额是否真实。确有货物交易行为并且应税销售额真实的，由稽查部门通知纳税评估岗位核定专用发票限额和用量，并由纳税评估岗位通知发票发售部门按照核定结果销售专用发票。
九、增值专用发票的管理工作和增值税纳税申报与纳税评估的管理工作，应由各级税务机关负责流转税管理的部门负责。凡目前尚未由负责流转税管理的部门进行管理的，2001年年底前一律移交负责流转税管理的部门进行管理。
基层征收管理部门应按《商贸企业增值税纳税评估办法》的规定设立相应岗位，专门负责纳税评估工作。
十、各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局，可在不违反本通知及其所附《商贸企业增值税纳税评估办法》规定的前提下，制定商贸企业增值税纳税评估的具体实施办法。
十一、对于商贸企业增值税纳税评估工作实行责任追究制的具体规定，另行下达。
附件：商贸企业增值税纳税评估办法
商贸企业增值税纳税评估办法
一、纳税评估内容
（一）防伪税控系统开具的销项税额的分析：
当期《增值税进项税额明细表》（附件1）以下称《明细表》，第1行“（一）防伪税控专用发票”项目中的“税额”数应等于当期金税工程报税系统所采集的销项税额数，不等于的属于异常。
商贸企业全部应税货物的销售均使用防伪税控系统开具专用发票，《明细表》第10行“（五）小计”项目中的“税额”数应等于《增值税纳税申报表》以下称《申报表》，第2、3、4行的“税额”数合计，不等于的属于异常。商贸企业只有部分应税货物销售使用防伪系统开具专用发票，《明细表》第10行“（五）小计”项目中的“税额”数应小于《申报表》第2、3、4行的“税额”数合计，大于或等于的属于异常。