2．应扣税金的计算和管理纳税人在购进扣除项目时，根据购货发票等税务机关认定的合法付款凭证，计算应扣税金，计算公式为：
应扣税金＝扣除项目金额×扣除税率
为归集和全面反映应扣税金计算、扣除和结存，纳税人必须建立“增值税扣除税金登记簿”，按扣除税率设置栏次，在登记簿的增加栏依记帐凭证逐项记载外购扣除项目金额，其登记内容应与会计帐簿相关科目相对应，对发生的应冲减的扣除项目金额，也在“增值税扣除税金登记簿”增加栏中用红字反映，冲减本期的外购扣除项目金额。一个纳税期满后，将各栏扣除项目金额汇总，分别乘以适用的扣除税率，计算出本期全部应扣税金。
3．应交税金的计算和管理
（1）采取分期核实方法的计算
增值税纳税人一般应采取分期核实方法计算缴纳增值税，应交增值税的计算公式为：
本期应交增值税＝本期整体税金－本期扣除税金
本期扣除税金即为“增值税扣除税金登记簿”的增加方期末汇总数。本期实际扣除税金在“增值税扣除税金登记薄”的减少栏进行登记，期末一般增减栏相抵后无余额。如发生本期应扣税金汇总数大于本期应税产品计算的整体税金的情况，将整体税金作为本期实际抵扣的扣除税额计入“扣除税金登记簿”的减少栏，增减栏相抵后，增加栏的期末余额为应在下一纳税期继续抵扣的扣除税金。
（2）采用定率征收，年终结算方法的计算。
对因季节性采购或其他原因按分期核实方法纳税造成税款入库很不均衡的纳税人，经县（区）一级税务机关批准，可采用定率预征，年终结算方法计算增值税。应税产品的征收率由税务机关根据纳税人上年的纳税情况核定，年内各纳税期应交税金按征收率计算，但同时应计算整体税金和本期实际扣除税金。计算公式为：
本期应交增值税＝∑（应税收入×征收率）
本期实际扣除税金＝本期整体税金－本期应交增值税
本期实际扣除税金记入“扣除税金登记簿”的减少栏。年度终了，全年增减栏相抵后的余额，如果在减少方，即为纳税人应缴未缴的增值税，如果在增加方，即为纳税人应扣未扣的税金。
4．减免税的计算
当企业生产的部分产品按规定享受减免税政策而又无法直接计算其减免税额时，可采取以下办法计算：
（1）免税产品的计算
对免税产品的计算可以采用先计算出全部产品的应交税金，然后结合企业的具体情况，以有关指标计算出一个比例，据此比例计算出免税产品的免税金额。可采用的计算方法主要有：销售收入比例法；整体税金比例法；成本比例法等。纳税人采取哪种方法计算，由税务机关确定。
（2）减税产品的计算
采用减率法的产品可以直接按降低后的税率计算整体税金，不需再单独计算减税额。
采用减额法的可以根据上面介绍的计算免税产品应纳税额的方法，计算出该产品的全部税额，再按规定的减税比例计算出减征税额。